La jornada electoral presentó brotes de violencia en por lo menos cuatro juntas auxiliares. Tanto representantes de planilla como votantes protestaron por las aparentes irregularidades que las listas nominales presentaron, pues no están ordenadas por ningún número de folio, a la vez que los nombres están en desorden o ni siquiera aparecen.
En la junta auxiliar Ignacio Romero Vargas se rompieron y quemaron boletas y urnas en por lo menos dos de las tres casillas, lo que provocó la suspensión del proceso de manera extraoficial.
Mientras tanto, en la junta de La Libertad, abrieron la casilla 8:30, alrededor de 500 personas protestaron por la falta de datos en las listas nominales para la identificación de los votantes. Hasta ahora las votaciones no se han anulado.
También en las juntas auxiliares de la Resurrección y San Aparicio se anularon las elecciones en varias casillas por las protestas de los representantes de planilla y votantes simpatizantes.
