Carlos de los Cobos finalizó su etapa con los Gallos Blancos. Luego de siete partidos en el presente Apertura 2012 de la Liga MX, la relación con la institución culminó con apenas un punto; seis duelos perdidos por sólo un empate.
El anuncio lo emitió el propio equipo queretano a través de un boletín, donde agradecen al ex técnico de El Salvador por sus servicios:
"Este día y por decisión propia, el Sr. Carlos de los Cobos Martínez ha decidido dejar la direcciónn técnica de nuestro equipo con la finalidad de permitir a la Directiva buscar alternativas encaminadas a revertir la situación actual", desplegó el club en su página oficial.